真空炉呈现故障常常是因为冷却体系出问题，冷却体系是真空炉的重要部分。冷却水路应坚持畅透，否则水温升高形成停机。这是真空炉工作经常披忽视的问题当无人管理时可能会导致真空炉的严重毁坏。
　　用生物分解化学辅助办法处理冷却水，意图是坚持矿物质呈悬浮态，削减橡皮管、蛇形管和水套内沉淀物累积，以使水流疏通。这一般选用一种自动装置来完结，它能够监测水的导电性，自动补充化学剂，冲冼水路，添加新鲜水。与隶属蒸气过滤体系配合，这种办法还能够确保水的pH值操控，避免在冷却水体系中剩余矿物质沉积。在体系工作安稳后，至少应每月一次进行水质实验以防过处理或欠过理。
　　真空炉外壳和热交换器材料的实验样品也应放在水路体系中，每年做一次分量损失检验以检查处理的作用。对分散泵的蛇形管冷却器必须特别注意。应该经常检查。如果堵塞了，分散泵将会过热并丧失功用，并且还进一步引起分散泵加热器烧毁，形成昂贵的、费时的修理。当蛇形冷却水管堵塞时，将水路同水源断开，排水并用压缩空气吹通或用稀醋酸溶液冲洗。